个人简介:
中山大学附属第七医院科研中心副研究员,硕士生导师,中山大学“百人计划”引进人才。于2018年获得中山大学生物化学与分子生化学博士,并于2019年1月-2021年6月在美国Cedars-sinai医学中心任博士后,2021年8月通过中山大学“百人计划”加入中山大学附属第七医院。以共同第一作者发表研究论文8篇,研究成果主要发表在Nature Communications、Nucleic Acids Research和Cancer Research等杂志上,其中有1篇论文入选为ESI高被引论文。
教育背景:
2009/09-2013/06 中山大学 海洋学院 学士
2013/09-2018/06 中山大学 生化与分子生物学 硕博连读
工作经历:
2019/01-2021/06 Cedars-sinai医学中心 博士后
2021/08-至今 中山大学附属第七医院 副研究员
主要研究方向:
课题组以食管癌等恶性疾病为模型,利用病人来源细胞系及临床组织等材料开展肿瘤表观遗传学研究。同时,结合公共数据资源TCGA,CCLE,ENCODE以及GEO等数据开展组学研究,利用生物信息学研究手段系统分析在肿瘤发展过程中的表观组水平的改变,并探讨肿瘤潜在的发生机制。目前课题组的主要方向有:
1. 探讨PRC2调控基因在肿瘤发展中的作用
2. 挖掘肿瘤发展中的重要转录因子调控环路
3. 解读DNA甲基化修饰对早期炎症、肿瘤的作用
4. 开发肿瘤表观遗传相关的资源库及分析工具
科研论文:
1. Zheng Y#, Huang G#, Silva TC, Yang Q, et al. A pan-cancer analysis of CpG Island gene regulation reveals extensive plasticity within Polycomb target genes. Nat Commun. (2021);12: 2485.
2. Huang Y#, Yang Q#, Zheng Y#, Lin L#, et al. Activation of bivalent factor DLX5 cooperates with master regulator TP63 to promote squamous cell carcinoma. Nucleic Acids Res (2021). doi:10.1093/nar/gkab679
3. Shi X#, Zheng Y#, Jiang L#, Zhou B#, et al. EWS-FLI1 regulates and cooperates with core regulatory circuitry in Ewing sarcoma. Nucleic Acids Res. (2020);48: 11434–11451.
4. Zheng Y#, Xu Q#, Liu M#, Hu H#, et al. lnCAR: A Comprehensive Resource for lncRNAs from Cancer Arrays. Cancer Res. (2019);79: 2076–2083.
5. Zheng Y#, Nie P#, Peng D#, He Z, et al. m6AVar: a database of functional variants involved in m6A modification. Nucleic Acids Res. (2018);46: D139–D145.
6. Zheng Y#, Guo J#, Li X#, Xie Y, et al. An integrated overview of spatiotemporal organization and regulation in mitosis in terms of the proteins in the functional supercomplexes. Front Microbiol. (2014);5: 573.
7. Zhao Q#, Xie Y#, Zheng Y#, Jiang S, et al. GPS-SUMO: a tool for the prediction of sumoylation sites and SUMO-interaction motifs. Nucleic Acids Res. (2014);42: W325–30.
8. Xie Y#, Zheng Y#, Li H#, Luo X, et al. GPS-Lipid: a robust tool for the prediction of multiple lipid modification sites. Sci Rep. (2016);6: 28249.
个人邮箱:
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