个人简介：

     中山大学附属第七医院科研中心副研究员，硕士生导师，中山大学高层次人才引进计划引进人才，深圳市卫生健康系统特聘 D 档人才。于 2018 年获得中山大学生物化学与分子生化学博士，并于 2019 年 1 月-2021 年 6 月在 Cedars-sinai 医学中心任博士后，2021 年 8 月加入中山 大学附属第七医院。以共同第一作者或通讯作者发表研究论文 11 篇，研究成果主要发表在 Nature Communications、Genome Biology、Nucleic Acids Research 和 Cancer Research 等杂志上。目前主持 国自然青年项目、广东省面上项目、深圳市面上项目、中山大学高校基本业务费团队项目子课题。

教育背景：

2009/09-2013/06  中山大学 海洋学院 学士

2013/09-2018/06  中山大学 生化与分子生物学 硕博连读

工作经历：

2019/01-2021/06  Cedars-sinai医学中心 博士后

2021/08-至今  中山大学附属第七医院 副研究员

主要研究方向:

1. 挖掘肿瘤发展中的重要转录因子调控环路
2. 解读 DNA 甲基化修饰对早期炎症、肿瘤的作用

3. 基于单细胞数据分析解析肿瘤发生发展机制
4. 开发肿瘤表观遗传相关的资源库及分析工具

科研项目主持经历：

• 国自然面上项目，基于单细胞转录组的胃肠道肿瘤转分化共识元程序鉴定及其调控机制探究，2026/01-2029/12，50万，在研，主持
• 国自然青年基金，肿瘤部分甲基化域的鉴定工具开发及其在食管癌中的应用研究，2023/01-2025/12，30万，结题，主持
• 广东省面上项目，肿瘤特异顺式作用调控元件的鉴定及在泛癌中的研究，2024/01-2026/12，15万，在研，主持
• 深圳市医学研究专项前言探索型一般项目，基于单细胞多组学的结直肠癌肝转移超级增强子调控机制研究，2025/01-2027/12，291万，在研，主持
• 深圳市科创委基础面上项目，大范围H3K27me3修饰域的功能及与部分DNA甲基化缺失域的关系研究，2023/10-2026/10，15万，在研，主持
• 深圳市科创委基础面上项目，食管癌亚型特异性低甲基化区域鉴定及其功能研究，2022/10-2025/10，15万，结题，主持
• 中山大学高校基本业务费，青年教师团队项目，2022/05-2023/04，6.75万，结题，子课题主持

科研论文：

1. Zheng Y^#(独立一作), Ziman B, Ho AS, Sinha UK, Xu LY, Li EM, Koeffler HP, Berman BP*, Lin DC*. Comprehensive analyses of partially methylated domains and differentially methylated regions in esophageal cancer reveal both cell-type- and cancer-specific epigenetic regulation. Genome Biol. 2023;24(1):193. doi: 10.1186/s13059-023-03035-3. JCR Q1, IF=9.4, SCI, 他引14
2. Zheng Y^#(共一第一), Huang G#, Silva TC, Yang Q, Jiang YY, Koeffler HP, Lin DC*, Berman BP*. A pan-cancer analysis of CpG Island gene regulation reveals extensive plasticity within Polycomb target genes. Nat Commun. 2021;12(1):2485. doi: 10.1038/s41467-021-22720-0. JCR Q1, IF=18.1, SCI, 他引39
3. Liu A^#, Liu Z^#, Jiang L^#, Huang A, Lin X, Li X, Liu B, Hu S, Pan Q, Huang J, Yin L, Jiang L, Yi W*, Mao W*, Zheng Y*（共通讯第二）, Shi X*. A Non-Canonical Core Transcriptional Regulatory Circuit Orchestrates Chromatin Reprogramming to Drive Osimertinib Resistance in Non-Small Cell Lung Cancer. Adv Sci (Weinh). 2026 May 20:e75765. doi: 10.1002/advs.75765. JCR Q1, IF=14.1, SCI, 他引0
4. Lou E, Lai P, Peng G, Lu B, Jiang L, Li X, Chen J, Mo L, Mao Q, Zhang H, Fang J, Meng Y, Liu A, Gao Y, Huang A, Lin W, Hu S, Guan Z, Ye X, Liu Z, Jiang L, Zheng Y*（共通讯第二）, Shi X*. Super-Enhancer-Driven SOX4/SMAD3 Mediate Membrane Remodeling by Regulating Phospholipid Metabolism to Accelerate Leukemia Progression. Adv Sci (Weinh). 2026 Feb 21:e12332. doi: 10.1002/advs.202512332. JCR Q1, IF=14.1, SCI, 他引0
5. Um JH^#, Zheng Y^#（共一第二）, Mao Q^#, Nam C, Zhao H, Koh YW, Shin SJ, Park YM*, Lin DC*. Genomic and Single-Cell Analyses Characterize Patient-Derived Tumor Organoids to Enable Personalized Therapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma. Cancer Res, 2025 Jul 15;85(14):2726-2742. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-24-2850. JCR Q1, IF=22.6, 他引19
6. Jiang Y^#, Zheng Y^#（共一第二）, Zhang YW^#, Kong S^#, Dong J, Wang F, Ziman B, Gery S, Hao JJ, Zhou D, Zhou J, Ho AS, Sinha UK, Chen J, Zhang S, Yin C, Wei DD, Hazawa M, Pan H, Lu Z, Wei WQ, Wang MR, Koeffler HP, Lin DC*, Jiang YY*. Reciprocal inhibition between TP63 and STAT1 regulates anti-tumor immune response through interferon-γ signaling in squamous cancer. Nat Commun. 2024;15(1):2484. doi: 10.1038/s41467-024-46785-9. JCR Q1, IF=18.1, SCI, 他引32
7. Lou E*, Jiang L*, Zheng Y*（共一第三）, Zhuo R*, Zhou H*, Hu S*, Shi C, Zhang H, Li X, Jiang L, Mao Q, Liu A, Liu B, Fang J, Pan J#, Shi X#. Super-Enhancer-Driven TCF4 Orchestrates Neuroblastoma Metastasis by Sphingolipid-Dependent Membrane Remodeling and ITGB1-FAK Activation. Neuro Oncol. 2026 Feb 2:noag021. doi: 10.1093/neuonc/noag021.JCR Q1, IF=13.1, 他引0
8. Jiang L*, Wang J*, Peng G*, Zhang H*, Fang J, Gao Y, Lou E, Liu Y, Ding W, Liu B, Mao Q, Jiang L, Liu A, Li X, Hu S, Ma Q, Zheng Y*（共通讯第三）, Zhao Z*, Shi X*. A Super-Enhancer-Driven Transcriptional Regulatory Circuit Underlying Abiraterone Resistance in Castration-Resistant Prostate Cancer. Adv Sci (Weinh). 2025 Aug;12(31):e01284. doi: 10.1002/advs.202501284. Epub 2025 Jun 5. JCR Q1, IF=14.1, SCI, 他引8
9. Nam C^#, Huang G^#, Zheng Y^#（共一排第三）, Zhao H, Pan Y, Hu B, Wenger T, Van HT, Xu LY, Li EM, Koeffler HP, Ge K, Dou Y, Sinha UK, Park YM*, Lin DC*. The MLL3/GRHL2 complex regulates malignant transformation and anti-tumor immunity in squamous cancer. J Exp Med. 2025;222(4):e20240758. doi: 10.1084/jem.20240758. JCR Q1, IF=11.6, SCI, 他引6
10. Liu M^#, Jiang L^#, Zhang L^#, Chen T^#, Wang X^#, Liang Y, Shi X*, Ren J*, Zheng Y*(最后通讯). CMAtlas: a comprehensive DNA methylation atlas for exploring epigenetic alterations in 34 human cancer types. Bioinformatics. 2026;42(2):btag022. doi: 10.1093/bioinformatics/btag022. PMID: 41533705; PMCID: PMC12881830. JCR Q1, IF=5.5, SCI, 他引0
11. Liang Y^#, Liu M^#, Liu B, Ziman B, Peng G, Mao Q, Wang X, Jiang L, Lin DC, Zheng Y*(最后通讯). Comprehensive analysis of H3K27me3 LOCKs under different DNA methylation contexts reveal epigenetic redistribution in tumorigenesis. Epigenetics Chromatin. 2025;18(1):6. doi: 10.1186/s13072-025-00570-0.  JCR Q1, IF=4.4, SCI, 他引10
12. Peng G, Liu B, Zheng M, Zhang L, Li H, Liu M, Liang Y, Chen T, Luo X, Shi X*, Ren J*,Zheng Y*(最后通讯). TSCRE: a comprehensive database for tumor-specific cis-regulatory elements. NAR Cancer. 2024 Jan 11;6(1):zcad063. doi: 10.1093/narcan/zcad063. PMID: 38213995. JCR Q2，IF=4.6，SCI
13. Huang Y^#, Yang Q^#, Zheng Y^#（共一第三）, Lin L^#, Xu X, Xu XE, Silva TC, Hazawa M, Peng L, Cao H, Ding Y, Lu D, Berman BP, Xu LY, Li EM, Yin D. Activation of bivalent factor DLX5 cooperates with master regulator TP63 to promote squamous cell carcinoma. Nucleic Acids Res. 2021 Sep 20;49(16):9246-9263. doi: 10.1093/nar/gkab679. PMID: 34370013. JCR Q1, IF=15, SCI, 他引2

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